Новенькая модель подразумевает, что еще больше видов млекопитающих, чем числилось ранее, могут стать хозяевами новейших коронавирусов. Невзирая на то, что большая часть коронавирусов, с которыми сталкиваются люди, обычно вызывают лишь легкие инфекции (Термин означает различные виды взаимодействия чужеродных микроорганизмов с организмом человека), три самых крайних новейших штамма – SARS-CoV-1, MERS-CoV и SARS-CoV-2, вызывающие COVID-19, — необыкновенно вирулентны и имеют относительно высочайший уровень летальности. У их также есть общая история происхождения: они все развились у остальных видов млекопитающих. Межвидовая передача является одним из более всераспространенных методов, при помощи которых ученые выяснят о новейших вирусах, но это также неописуемо трудно моделировать и предвещать. Усложняет процесс вирусная рекомбинация: когда два различных вируса заражают одну и ту же клеточку и обмениваются генетической информацией для сотворения совсем новейших вирусов. Варианты вируса могут быть сделаны номинальными мутациями генома 1-го вируса, приводящими к маленьким изменениям параметров вируса.
Рекомбинантные вирусы
В процессе исследования, размещенного в журнальчике Nature Communications, биолог Майя Варде и вирусолог Маркус Благроув из Ливерпульского института разработали модель машинного обучения, чтоб предсказать, какие млекопитающие могут быть хозяевами новейших рекомбинантных вирусов.
Модель, разработанная исследователями предсказала, что по сопоставлению с прошлыми наблюдениями сейчас число ассоциаций коронавирус-млекопитающее было в 11 раз больше. Наиболее того, количество видов млекопитающих, которые, возможно, являются хозяевами для рекомбинации коронавирусов, подросло наиболее чем в 40 раз. По воззрению создателей научной работы это свидетельствует о том, что потенциал генерации коронавируса у млекопитающих быть может существенно недооценен.
Стоит гласить, что результаты, приобретенные учеными, вызывают беспокойство. На нынешний денек науке понятно о существовании 43 видов коронавирусов, но их быть может намного больше. «Мы должны научиться предвещать происхождение новейших коронавирусов, чтоб хорошо сосредоточить ресурсы и избрать верную стратегию действий, ведь когда новейшие коронавирусы перекинуться на человека, будет уже очень поздно», – пишут создатели исследования.
Вирусный метод
Отметим, что разработанная в процессе исследования модель учитывает последовательности генома узнаваемых коронавирусов и млекопитающих также данные о том, где территориально живут млекопитающие, чем питаются и как соединены иными звериными. Другими словами, ученым удалось подключить имеющиеся био данные к методу, другими словами обучить комп распознавать вирусы и виды-хозяев, которые, быстрее всего, являются источником рекомбинации.
«Мы смогли предсказать, какие виды млекопитающих потенциально могли заразить остальных звериных коронавирусами», — растолковала Майя Варде в интервью BBC. «Или поэтому, что они весьма тесновато соединены с носителем коронавируса, или поэтому, что делят одно и то же географическое место», — произнесла она.
Огромным препятствием для метода, но, сделалось отсутствие современных познаний о том, как определенные вирусы заражают определенных владельцев. «У нас есть весьма ограниченные и тенденциозные данные для метода машинного обучения, чтоб обучаться на их», — произнесла Николь Уилер, спец по данным Центра геномного надзора за патогенами США (Соединённые Штаты Америки – государство в Северной Америке). «Механизмы, определяющие, может ли вирус заразить владельца и могут ли разные вирусы смешиваться, очень сложны и зависят от причин, о которых у нас нет огромных размеров данных.»
Тем не наименее новое исследование представляет собой потенциально модифицирующее применение машинного обучения для эпиднадзора за заболеваниями и может посодействовать пролить свет на остальных владельцев коронавируса млекопитающих, на которых нам всем стоило бы направить внимание. Недавнешние исследования уже подтвердили ряд пророчеств модели: как оказывается, альпака, домашняя коза и енотовидная собака восприимчивы к SARS-CoV-2. Так что винить в сегодняшней пандемии одних лишь летучих мышей либо панголинов некорректно. Более броско, что модель идентифицирует 102 возможных владельца для тревожной рекомбинации SARS-CoV-2 с MERS-CoV, который еще наиболее смертоносен чем COVID-19.
По воззрению вирусологов, которые не воспринимали роли в исследовании, новенькая работа подчеркивает значимость своевременноо обнаружения новейших коронавирусов, также свидетельствует о том, что недозволено недооценивать количество возможных владельцев посреди млекопитающих. Желаем мы этого либо нет, но звериные, включая человека, сосуществуют с огромным количеством вирусов. Можно даже сказать, что население земли боролось с вирусами в протяжении всей истории, а эпидемии и пандемии игрались гигантскую роль в развитии нашей цивилизации. По данной нам (и почти всем иным причинам), последующие исследования весьма важны, сами Варде и Благров не колеблются в том, что эпидемия COVID-19 не крайняя, а означает нужно как надо приготовиться к последующим.